Hi,
also ich würde es so machen das ich als aller erstes mal ein Backup von allem mache, sprich Webspace und Datenbank(en). Und dann würd ich das so auf den neuen Server einspielen das der Shop dort einwandfrei funktioniert, und dann auf 1.06 updaten. Das halte ich für die sicherste Lösung, wenn dann was schief geht bekommst du keine grauen Haare, würde jedenfalls an der laufenden und funktionierenden Installation nichts ändern
Also in deinen Worten, Variante 1