Ja, das ist korrekt. Die Option $UseSendmailOptions muss auf false gesetzt werden, weil mini_sendmail die Paramater -oi nicht handeln kann.
Damit der Enduser das nicht manuell in der class.phpmailer.php umstellen muss, müsste dies eigentlich im Admin-UI hinzugefügt werden, wie du es vorschlägst.
Bei den E-Mail Options fällt mir auch auf, dass das Feld "The Path to sendmail" automatisch mit /usr/sbin/sendmail ausgefüllt wird. Woher kommt dieser Wert? Sollte dieser nicht automatisch von ini_get("sendmail_path") eingelesen werden?