Hallo White,
wenn du 2 Shops und eine Datenbank verwenden möchtest, dann deaktiviert sich im 1. Shop die Kategorie, die du im 2. Shop deaktivierst. Leg dir besser eine 2. Datenbank für den 2. Shop an.
Dann hast du es sauber getrennt.
Schöne Grüße,
Jan