Also, Magnalister habe ich getestet und bis auf nicht importierte Kategorien, hat das Teil gut funktioniert. Der Support meinte, er habe wohl das gleich Problem vor kurzem schonmal geschildert bekommen und arbeite daran.
Zu dem Modul für xtc3. Nachdem ich die Attribute auf eine Ebene beschränkt habe, den Cache leerte und erneut den Crontab ausführte, funktonierte dies schon viel besser. Die Attribute und Kategorien wurden richtig übergebe, nur einige Produkte fehlten.
Nach langem suchen fand ich schließlich auch das Problem, allen Produkte in denen meine Produktbeschreibung formatiert wurde, wurden erst übertragen, nachdem ich die Formatierung des Textes entfernte. Keine Ahnung warum das so ist, aber danach ließen sich auch diese Produkte einspielen!
Das war die Formatierung:
<p><span style="font-weight:"><br />
</span></p>