Hallo Tiger,
ich kann Dir nicht ganz folgen. Du hast also einen neuen modified eCommerce Shopsoftware Shop installiert? Und eine Kopie von einem anderen modified eCommerce Shopsoftware Shop gemacht?
Und nun kommt der Hinweis, dass Du die Berechtigungen ändern sollst. Das steht so auch im Handbuch. Das kann man für jede Datei manuell mit dem FTP Programm machen, oder Du nutzt, wie von sv.brueck vorgeschlagen, ein Script.
Was hat aber nun der eine mit dem andern Shop zu tun? Wolltest Du auf eine andere Domain umziehen?
Viele Grüße
Mario