Grundsätzlich kann man das
?>
weglassen, wenn es eine reine PHP-Datei ist.
Ich selbst mag den Stil ohne schließendes PHP-Tag nicht, setze es deshalb auch immer.
Es soll auch Server geben, die damit ein Problem haben es wegzulassen, zumindest habe ich das so in Erinnerung. Man möge mich korrigieren.
Bei deinem Beispiel hast du einen Kommentar dazwischen, der nicht geschlossen wurde.
Das schließende PHP-Tag hast du damit auskommentiert.
So wäre es richtig
<?php
/* --------------------------------------------------------------
$Id: start.php 3099 2012-06-20 17:32:53Z Tomcraft1980 $
}
*/
?>